四校合并：2003年4月，江汉石油学院、湖北农学院、荆州师范学院、湖北省卫生职工医学院合并组建成长江大学。2003年底，学校院系调整工作全面完成。全校设置24个教学院(系)。设置的院系有：经济学院、政法学院、体育学院、文学院、外国语学院、艺术学院、信息与数学学院、物理科学与技术学院、化学与环境工程学院、生命科学学院、石油工程学院、地球物理与石油资源学院、地球科学学院、机械工程学院、电子信息学院、计算机科学学院、城市建设学院、农学院、园艺园林学院、动物科学学院、医学院、管理学院、教育科学系、地球化学系。
2008年，长江大学武汉校区开始建设，经过3年的规划设计和施工建设，已于2011年全部建成，并于2012年初投入科研和教学使用。2010年10月3日，举行长江大学组建 8 周年暨石油教育 60 年、农学教育 33 年、师范教育 74 年、医学教育 59 年庆典[9] ；同时，湖北省人民政府与中石油、中石化、中海油三大石油公司签署协议，共建长江大学。2013年10月，在长江大学组建10周年之际，原中共中央政治局常委、国务院副总理李岚清同志题词：“德智体美”，希望学校坚持社会主义办学方向，培养德智体美全面发展的社会主义建设者和接班人。
